28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0509 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0509  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 461 aa  887    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1000  outer membrane efflux protein  29.8 
 
 		 448 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495217  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6010  outer membrane efflux protein  30.2 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 		 438 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  20.28 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  18.6 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.35 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  27.35 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.16 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 409 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3443  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.77 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 		 497 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 455 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  20.26 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>