More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0481 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  28.61 
 
 
1677 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
1827 aa  845    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
3145 aa  6450    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
1450 aa  609  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.18 
 
 
1034 aa  550  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
1038 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
1005 aa  527  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
688 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.98 
 
 
689 aa  403  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
1451 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
1454 aa  378  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.5 
 
 
1764 aa  374  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
1212 aa  374  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
923 aa  360  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 
602 aa  351  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.54 
 
 
714 aa  347  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
714 aa  345  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
601 aa  341  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
615 aa  339  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
681 aa  339  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 
620 aa  338  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.33 
 
 
703 aa  337  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
637 aa  334  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
767 aa  333  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.75 
 
 
620 aa  333  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  41.77 
 
 
400 aa  331  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
935 aa  322  6e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.12 
 
 
574 aa  319  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  42.58 
 
 
780 aa  319  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
578 aa  318  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
662 aa  316  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
955 aa  310  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.78 
 
 
648 aa  308  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 
608 aa  307  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.8 
 
 
733 aa  307  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  40.45 
 
 
397 aa  306  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.31 
 
 
760 aa  303  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
542 aa  301  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  41.84 
 
 
848 aa  301  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.35 
 
 
577 aa  300  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
523 aa  299  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.82 
 
 
653 aa  296  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
653 aa  296  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  29.65 
 
 
1077 aa  296  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
740 aa  291  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  33.44 
 
 
603 aa  288  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.08 
 
 
626 aa  288  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
646 aa  286  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
614 aa  284  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.34 
 
 
626 aa  284  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 
626 aa  281  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
614 aa  281  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 
614 aa  281  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
637 aa  281  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
649 aa  281  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
649 aa  281  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 
614 aa  281  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
639 aa  279  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
612 aa  277  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
556 aa  275  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
611 aa  273  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
1073 aa  272  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
614 aa  272  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
747 aa  271  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
636 aa  270  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  37.53 
 
 
472 aa  269  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
583 aa  269  8e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  42.34 
 
 
878 aa  268  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  38.99 
 
 
872 aa  266  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
635 aa  265  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
635 aa  265  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.43 
 
 
473 aa  264  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
592 aa  258  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.14 
 
 
810 aa  258  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
607 aa  254  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
747 aa  253  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
520 aa  252  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 
615 aa  252  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 
412 aa  249  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 
529 aa  248  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
546 aa  238  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  26.78 
 
 
630 aa  236  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.57 
 
 
632 aa  235  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.68 
 
 
550 aa  234  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
457 aa  234  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
636 aa  233  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
438 aa  232  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.39 
 
 
604 aa  232  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
527 aa  232  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.75 
 
 
454 aa  229  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
505 aa  228  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
607 aa  226  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
909 aa  224  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
484 aa  225  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  28.54 
 
 
540 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
595 aa  224  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.65 
 
 
503 aa  223  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
611 aa  221  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
566 aa  220  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
558 aa  218  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>