107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2923 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  799    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 		 3145 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  44.55 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  35.5 
 
 		 848 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3834  glycosyl transferase group 1  37.92 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3749  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 679 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  33.97 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  32.2 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  24.35 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  29.27 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  50.91 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  27.42 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 930 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  25.4 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  23.03 
 
 		 1635 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  26.49 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  31.61 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  42.47 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  26.63 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 1241 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.84 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 467 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 623 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.41 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 436 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  25.97 
 
 		 420 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  27.57 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 899 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.52 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1146  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00446094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 1261 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 448 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  29.41 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  24.64 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.92 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.92 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.92 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 739 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  25.59 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 810 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1408  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>