115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3864 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  100 
 
 		 400 aa  818    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 		 3145 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  44.55 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  35.79 
 
 		 848 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3749  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3834  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 357 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 		 679 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  27.02 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  29.82 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 899 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  29.27 
 
 		 437 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 388 aa  49.7  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  25 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  27.98 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  23.97 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  44.07 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  26.46 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  24.51 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 1229 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  37.5 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  23.98 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  25.09 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  24.73 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  21.45 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1408  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  32.73 
 
 		 343 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  29.71 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  24.91 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  25 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  25.9 
 
 		 466 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  20.37 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  21.51 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>