More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2591 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  100 
 
 		 501 aa  971    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1688  GntR domain-containing protein  41.92 
 
 		 312 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0152268  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 261 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 261 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 261 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 253 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  35.03 
 
 		 267 aa  94.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.36 
 
 		 243 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 246 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  32.76 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  29.79 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.65 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  28.18 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  32.49 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 241 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  30.41 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  28.45 
 
 		 258 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  27.71 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4707  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  25.43 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  31.1 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  29.13 
 
 		 257 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 261 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  30.71 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 218 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 238 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  34.83 
 
 		 242 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  26.52 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  32.85 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.09 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  28.63 
 
 		 239 aa  67  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.5 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  27.36 
 
 		 222 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  27.15 
 
 		 241 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.93 
 
 		 253 aa  66.6  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 256 aa  66.6  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  31.22 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  30.29 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.3 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  26.94 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  30.54 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  29 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  25.97 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  29.67 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  26.01 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.27 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  32.66 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  27.54 
 
 		 268 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  30.99 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 233 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  30.88 
 
 		 250 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 273 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  25.79 
 
 		 244 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  25.22 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  24.78 
 
 		 241 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  29.73 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  32.32 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.38 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  28.57 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  24.18 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 251 aa  62  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 268 aa  62  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  24.18 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 232 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 255 aa  62  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>