182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2329 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  74.76 
 
 		 219 aa  313  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  63.59 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  66.03 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.14 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  51.38 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  51.2 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  55.32 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  55.32 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.77 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  53.72 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  51.3 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  48.11 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.91 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.82 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  27.73 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  27.61 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.75 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.32 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  30.39 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  30.92 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.84 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  52.54 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  22.84 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  31.76 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.59 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  42.67 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  27.69 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  25.99 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  29.5 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.11 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  36.63 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  23.61 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  23.77 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.25 
 
 		 543 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  25.78 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.57 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  31.13 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.21 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  26.22 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.22 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  30.6 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.43 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.03 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.43 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.91 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  35 
 
 		 265 aa  48.9  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.69 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  23.32 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  37.35 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  34.62 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.19 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.24 
 
 		 263 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  22.47 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  30.39 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  30.91 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.27 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.19 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  27.67 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  22.13 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.28 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2974  hydrolase  34.58 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.37 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1535  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.92 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.918107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  29.76 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  28.03 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  44.44 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.03 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27.7 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  40.91 
 
 		 254 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  32.43 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  32.71 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.08 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>