More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0102 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  71.82 
 
 		 482 aa  771    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  70.65 
 
 		 481 aa  744    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  98.55 
 
 		 482 aa  997    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  72.03 
 
 		 482 aa  773    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  1004    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  42.67 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 466 aa  356  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  40.28 
 
 		 479 aa  352  8.999999999999999e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  38.52 
 
 		 460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  39.21 
 
 		 458 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  40.1 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  37.21 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  36.43 
 
 		 452 aa  312  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  37.21 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  34.28 
 
 		 462 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  35.09 
 
 		 461 aa  286  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  37.89 
 
 		 477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  37.1 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  35.88 
 
 		 471 aa  273  6e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 446 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  37.17 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  37.17 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  34.39 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  31.83 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 371 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  31.91 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  30.19 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  24.91 
 
 		 379 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 330 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  27.67 
 
 		 769 aa  93.6  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.8 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 501 aa  91.7  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.78 
 
 		 390 aa  90.9  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 480 aa  90.9  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 414 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 319 aa  89.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 358 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.21 
 
 		 346 aa  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 496 aa  88.2  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  25.56 
 
 		 381 aa  86.7  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  26.96 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.3 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  23.63 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.09 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.49 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 323 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  24.72 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  36.77 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  36.77 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.32 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  34.51 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.08 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  36.71 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.19 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  24.84 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  29.41 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  29.53 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  37.84 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>