More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2073 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 417 aa  858    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  50.68 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.36 
 
 		 622 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.51 
 
 		 764 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1676 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.92 
 
 		 632 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.41 
 
 		 1694 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 467 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.44 
 
 		 810 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.08 
 
 		 936 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1371 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 784 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.25 
 
 		 988 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 878 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 		 818 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 4079 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.18 
 
 		 837 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 1056 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.88 
 
 		 887 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 927 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1022 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 3172 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.48 
 
 		 1979 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.83 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.93 
 
 		 2401 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.93 
 
 		 2145 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.65 
 
 		 1056 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  21.45 
 
 		 561 aa  77  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.6 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.17 
 
 		 1186 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1138 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  21.13 
 
 		 626 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 2059 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.83 
 
 		 689 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 722 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 612 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  21.14 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.36 
 
 		 676 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 750 aa  73.6  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.32 
 
 		 2240 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 		 3301 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1406 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.1 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  22.5 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  21.2 
 
 		 711 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  19.12 
 
 		 968 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 767 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 1069 aa  69.7  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.93 
 
 		 573 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  21.64 
 
 		 1073 aa  69.7  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  19.37 
 
 		 626 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  19.37 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  19.37 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  19.37 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  19.37 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.11 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  19.37 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  21.79 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  19.37 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 1276 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  21.18 
 
 		 1094 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 4489 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 		 1297 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 		 758 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.81 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  22.26 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.53 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  22.38 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>