More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0430 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2237  site-specific recombinase XerD-like  54.64 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0311543  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  29.72 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  38.46 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  30.33 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  30.33 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  37.66 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  29.15 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  31.94 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.72 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.96 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  34.52 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  29.39 
 
 		 311 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  27.21 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  27.8 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  30.74 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  27.08 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.55 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.31 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  28.37 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  29.76 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.18 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.34 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.1 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  29.14 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  29.14 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  34.62 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  27.99 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  29.02 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  28.46 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  29.15 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  28.51 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  28.57 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  22.67 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  23.27 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  24.73 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  24.73 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  32.44 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  28.37 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  28.97 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.69 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  31.39 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  27.93 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25.77 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  33.14 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  27.93 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  34.48 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  27.15 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  34.83 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.11 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  29.14 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  30.45 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.56 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  28.47 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  30.9 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  26.67 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  35.57 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.78 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.52 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  27.27 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  30.58 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  31.39 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.15 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  29.22 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  31.39 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  28.07 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  34.44 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  31.27 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  30.26 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>