More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0741 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  27.34 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  28.91 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  34.52 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.61 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  24.64 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31.78 
 
 		 177 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  26.47 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  26.87 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.27 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.27 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.27 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  27.48 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  24.66 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  27.27 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  25.47 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>