171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1361 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1361  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 416 aa  843    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.824117  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 419 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.36 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  28.54 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  19.37 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.34 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  22.03 
 
 		 606 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.7 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  29.09 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.87 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.54 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0908  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.16 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.53 
 
 		 600 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.47 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.48 
 
 		 474 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2494  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.48 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  22.14 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.67 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  29.17 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.99 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  21.97 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.4 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.27 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.48 
 
 		 474 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.28 
 
 		 467 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  20.68 
 
 		 488 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 458 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.43 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.29 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.06 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  19.95 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.76 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  22.6 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  30.09 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2915  outer membrane efflux protein  32.35 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  21.79 
 
 		 469 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  34.07 
 
 		 515 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.77 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  21.07 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.84 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.97 
 
 		 517 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.79 
 
 		 469 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.34 
 
 		 517 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.58 
 
 		 469 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.56 
 
 		 471 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.79 
 
 		 469 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  29 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  21.41 
 
 		 456 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  22.53 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  19.24 
 
 		 527 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0124  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.638422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.77 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.89 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5228  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 513 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.06 
 
 		 504 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.28 
 
 		 482 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25 
 
 		 513 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5350  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 513 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00199019  normal  0.49097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  19.45 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.78 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  20.1 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.73 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.45 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  21.41 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.63 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3710  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 564 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  21.56 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.22 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>