83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3406 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 479 aa  936    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  68.05 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  61.7 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  62.47 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  61.12 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  62.17 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  59.58 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  58.66 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  61.97 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  55.49 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  61.27 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  58.47 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  57.73 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  61.44 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  60.57 
 
 		 557 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  54.73 
 
 		 493 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  57.65 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  65.57 
 
 		 361 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  53.78 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  54.69 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  53.2 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  61.68 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.58 
 
 		 462 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  55.8 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  54.53 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  52.89 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  50.1 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  54.07 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  51.23 
 
 		 452 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  55.62 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  56.6 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.95 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  52.99 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  55.46 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  51.54 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  57.14 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  52.07 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  56.39 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  51.23 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  55.97 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  53.66 
 
 		 476 aa  362  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  52.77 
 
 		 446 aa  352  8e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  62.37 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  51.43 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  53.44 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  48.77 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.54 
 
 		 509 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  39.33 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  40.95 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.07 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  39.32 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  39.82 
 
 		 501 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  36.44 
 
 		 523 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  37.8 
 
 		 532 aa  187  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.7 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.19 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  35.86 
 
 		 673 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  37.41 
 
 		 840 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  45.54 
 
 		 168 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.45 
 
 		 767 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  26.67 
 
 		 759 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  32.39 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.54 
 
 		 1296 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.16 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  27.08 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.04 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  38.78 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  29.61 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  40.88 
 
 		 717 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  25.97 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.82 
 
 		 2160 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  29.94 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1318 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  31.34 
 
 		 1037 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.48 
 
 		 601 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.61 
 
 		 863 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45402  predicted protein  29.03 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.68 
 
 		 884 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.79 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  26.94 
 
 		 1332 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  32 
 
 		 1755 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.4 
 
 		 2192 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>