148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2255 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 440 aa  888    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  40.59 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  39.57 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  39.17 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  36.45 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.59 
 
 		 484 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.24 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  25.12 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.88 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.71 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.14 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.88 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.92 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.23 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.01 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.81 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  21.09 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.08 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  25 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  21.78 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1543  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.793818  normal  0.0319696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 447 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1215  extracellular solute-binding protein  20.76 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000245671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.35 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>