132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0326 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0326  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2533  TetR family transcriptional regulator  88.26 
 
 		 252 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0277  TetR family transcriptional regulator  83.72 
 
 		 261 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0298  TetR family transcriptional regulator  81.96 
 
 		 267 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.985491  normal  0.0279616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4183  TetR family transcriptional regulator  85.49 
 
 		 263 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1415  TetR family transcriptional regulator  81.57 
 
 		 260 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3627  TetR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4177  TetR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  25.62 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4025  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0233  hypothetical protein  26.46 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 194 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 199 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1585  regulatory protein, TetR  44.68 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000139754  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3998  hypothetical protein  21.67 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13761 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.19 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 230 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 195 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  45.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0290  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  29.69 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  40 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  20.8 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 193 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>