More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5045 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  407  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 226 aa  117  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 424 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.56 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.96 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.66 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.22 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  24.86 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  35.92 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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