More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6215 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
440 aa  914    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  55.41 
 
 
451 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  53.93 
 
 
457 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  48.65 
 
 
448 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  49 
 
 
445 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  48.4 
 
 
437 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  47.19 
 
 
480 aa  346  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  42.32 
 
 
447 aa  335  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  40.74 
 
 
434 aa  302  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  39.58 
 
 
435 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  36.32 
 
 
483 aa  250  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 
501 aa  226  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  31.57 
 
 
421 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
462 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
427 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 
458 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 
455 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 
436 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 
451 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
434 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 
476 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
439 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
451 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 
428 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  28.54 
 
 
449 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
464 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
483 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
471 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  36.97 
 
 
481 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 
476 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
490 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
477 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
484 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
499 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 
428 aa  136  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
469 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
444 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  25.73 
 
 
450 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 
462 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  27.29 
 
 
444 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  22.81 
 
 
452 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
406 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
460 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
423 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
485 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
459 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  22.86 
 
 
421 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 
459 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 
459 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 
459 aa  87  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.71 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
382 aa  84  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 
329 aa  79.7  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
355 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  22.47 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 
358 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.85 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  31.1 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.51 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.2 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>