More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3574 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  27.34 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  25.27 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  27.68 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.52 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.71 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  23.88 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5529  UspA domain protein  22.26 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  23.49 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  23.13 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.71 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25.17 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.22 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  20.91 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  20.42 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  28.67 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3544  hypothetical protein  21.65 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  23.84 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  26.28 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  26.15 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  26.73 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.34 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  23.27 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  27.18 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.48 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  27.72 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  24.75 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  24.83 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.47 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  27.41 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  26.71 
 
 		 153 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  25.9 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.67 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  23.55 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.86 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.4 
 
 		 139 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  26.77 
 
 		 130 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 138 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  23.97 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  26.75 
 
 		 155 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  22.83 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.78 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26.73 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  23.31 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  22.64 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  31.47 
 
 		 152 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 153 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  22.8 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  33.67 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.21 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  26.94 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  33.58 
 
 		 166 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  22.1 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  30.48 
 
 		 108 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.56 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  30.71 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  23.23 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 449 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  26.71 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  25.17 
 
 		 152 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  31.76 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  24.83 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  25.7 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  29.31 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  29.31 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  29.31 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.3 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.71 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  31.51 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  28.21 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  25.35 
 
 		 142 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  30.43 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  22.9 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  18.48 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  28.31 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.85 
 
 		 153 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  28.97 
 
 		 143 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0609  UspA domain protein  26.42 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.6 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  25.17 
 
 		 152 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  23.21 
 
 		 160 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  24.52 
 
 		 170 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  24.52 
 
 		 170 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  25.9 
 
 		 159 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.56 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 141 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>