More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 853 aa  1672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.51 
 
 		 881 aa  168  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  27.45 
 
 		 876 aa  147  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1823  transcriptional regulator, LuxR family  26.65 
 
 		 846 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  31.35 
 
 		 865 aa  84.3  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.03 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  55 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.17 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 218 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  44.68 
 
 		 1006 aa  60.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  58.93 
 
 		 907 aa  60.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 206 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 981 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.16 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 973 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 215 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 215 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 218 aa  57.4  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  32.43 
 
 		 210 aa  57  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 471 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 912 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 210 aa  56.6  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 454 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 950 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 960 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 208 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  53.85 
 
 		 937 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 206 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 919 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  40.28 
 
 		 228 aa  55.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4137  regulatory protein LuxR  49.06 
 
 		 252 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.272227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 229 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 217 aa  55.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 541 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 191 aa  55.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.3 
 
 		 904 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 927 aa  54.7  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 231 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.27 
 
 		 229 aa  54.7  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 238 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 201 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 250 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  59.52 
 
 		 895 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5550  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 213 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159917  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 217 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05830  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.45 
 
 		 238 aa  54.3  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 998 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 216 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 219 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 386 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 212 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 232 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 303 aa  53.9  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 210 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  45 
 
 		 231 aa  54.3  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 224 aa  54.3  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  50.91 
 
 		 917 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 212 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 215 aa  53.9  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 918 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  50.91 
 
 		 228 aa  53.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  56.82 
 
 		 213 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  46.15 
 
 		 318 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 426 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 229 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.07 
 
 		 216 aa  53.5  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 937 aa  53.5  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 903 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 212 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 207 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 244 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 214 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 920 aa  53.5  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  51.06 
 
 		 220 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 220 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  55.1 
 
 		 967 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  45.45 
 
 		 233 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 226 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 951 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  49.09 
 
 		 213 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 864 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 228 aa  52.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 214 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 214 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 253 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>