More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 416 aa  830    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  43.6 
 
 		 438 aa  348  8e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  42.67 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  37.92 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  39.26 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 428 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.54 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 450 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  28.54 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  27.85 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  25.98 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.43 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 422 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 430 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.42 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  23.3 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  23.3 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 436 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 438 aa  97.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.73 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.4 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.61 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.86 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.82 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.63 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.1 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>