More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1573 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  42.57 
 
 		 1162 aa  760    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  39.31 
 
 		 1169 aa  726    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  74.17 
 
 		 1138 aa  1598    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  39.64 
 
 		 1167 aa  675    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  42.07 
 
 		 1162 aa  769    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  89.69 
 
 		 1145 aa  1944    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  41.65 
 
 		 1162 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  38.68 
 
 		 1164 aa  709    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1164 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  51.01 
 
 		 1139 aa  1026    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  41.48 
 
 		 1162 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  37.58 
 
 		 1171 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  37.63 
 
 		 1171 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  40.27 
 
 		 1165 aa  689    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  38.12 
 
 		 1165 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  53.64 
 
 		 1141 aa  1059    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  40.77 
 
 		 1170 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  43.98 
 
 		 1162 aa  784    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  39.56 
 
 		 1167 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 		 1175 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  53.6 
 
 		 1140 aa  1056    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  39.15 
 
 		 1167 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  41.15 
 
 		 1162 aa  763    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  39.56 
 
 		 1167 aa  714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  38 
 
 		 1198 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  39.77 
 
 		 1168 aa  741    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  38.15 
 
 		 1198 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  52.27 
 
 		 1138 aa  1023    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  37.94 
 
 		 1175 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  76.4 
 
 		 1145 aa  1699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  41.82 
 
 		 1164 aa  764    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  74.43 
 
 		 1138 aa  1604    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  38.2 
 
 		 1164 aa  682    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  74.52 
 
 		 1138 aa  1608    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1162 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  42.46 
 
 		 1162 aa  756    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  43.18 
 
 		 1164 aa  818    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  39.9 
 
 		 1169 aa  734    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  42.31 
 
 		 1162 aa  754    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  98.25 
 
 		 1142 aa  2245    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1142 aa  2286    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  54.98 
 
 		 1144 aa  1066    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  42.57 
 
 		 1162 aa  761    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  41.95 
 
 		 1162 aa  767    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  55.09 
 
 		 1133 aa  1118    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.46 
 
 		 1168 aa  732    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  96.94 
 
 		 1142 aa  2125    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  48.85 
 
 		 814 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  74.61 
 
 		 1138 aa  1605    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  38.55 
 
 		 1170 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  37.6 
 
 		 1171 aa  635  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  38.63 
 
 		 1170 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  38.34 
 
 		 1170 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  38.49 
 
 		 1175 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  38.42 
 
 		 1170 aa  632  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  38.5 
 
 		 1170 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  37.75 
 
 		 1172 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  37.59 
 
 		 1174 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  38.45 
 
 		 1206 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  37.4 
 
 		 1174 aa  625  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  37.62 
 
 		 1181 aa  621  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  37.97 
 
 		 1171 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  38 
 
 		 1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  37.54 
 
 		 1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  37.42 
 
 		 1170 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1268 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  37.34 
 
 		 1202 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  37.42 
 
 		 1171 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  36.88 
 
 		 1182 aa  611  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  37.34 
 
 		 1200 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  38.11 
 
 		 1142 aa  599  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  36.97 
 
 		 1190 aa  588  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  35.91 
 
 		 1173 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  34.63 
 
 		 1152 aa  542  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  35.43 
 
 		 1167 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.79 
 
 		 1175 aa  498  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  34.34 
 
 		 1150 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  34.34 
 
 		 1150 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 		 1176 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  77.13 
 
 		 299 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.79 
 
 		 1187 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.9 
 
 		 1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.26 
 
 		 1189 aa  439  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.15 
 
 		 1189 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.02 
 
 		 1189 aa  435  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.15 
 
 		 1189 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  29.94 
 
 		 1189 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  29.96 
 
 		 1189 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  29.96 
 
 		 1189 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 		 1163 aa  426  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 		 1191 aa  420  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 		 1188 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.72 
 
 		 1189 aa  412  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.13 
 
 		 1188 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  27.9 
 
 		 1190 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.77 
 
 		 1184 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.64 
 
 		 1186 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>