114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 327 aa  669    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  55.03 
 
 		 328 aa  346  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  50.16 
 
 		 330 aa  311  9e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  36.92 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.62 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.59 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.55 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.01 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  24.75 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.18 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.62 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.44 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.46 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  24.66 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  21.1 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  21.81 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.43 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.71 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  21.86 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  27.21 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.11 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  24.45 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  20.69 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  20.69 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.28 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  21.38 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  20.69 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  20.21 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  20.69 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  20.69 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  20.38 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  20.38 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  20.38 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  20.38 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  20.38 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.19 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  20.38 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  26.29 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  20.48 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  19.44 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.65 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  27.59 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.2 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  22.08 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  18.24 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  22.42 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  24.54 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.65 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  26.49 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.43 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  21.45 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  22.93 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  25.79 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.64 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  23.84 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  23.71 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.53 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  26.72 
 
 		 465 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.46 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.57 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  19.12 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  21.99 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  24.89 
 
 		 465 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  24.89 
 
 		 465 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  19.24 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  23.7 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  19.24 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  23.91 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  23.96 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  24.28 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  26.15 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  21.86 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  28.15 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  26.97 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  27.87 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  23.24 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  20.53 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  26.57 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  24.88 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  22.91 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  21.3 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  23.23 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  23.24 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  20.08 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  22.18 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  30.18 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  26.84 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>