73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2651 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1261    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 508 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  43.43 
 
 		 848 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  37.6 
 
 		 816 aa  68.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  39.22 
 
 		 783 aa  66.6  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  35.29 
 
 		 956 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  43.43 
 
 		 848 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  30.57 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  40.82 
 
 		 855 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  35.77 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  30.68 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.81 
 
 		 351 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  34.65 
 
 		 1107 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  34.13 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 868 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  29.91 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  39.18 
 
 		 1750 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  37.62 
 
 		 820 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  34.74 
 
 		 972 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 		 868 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  37.63 
 
 		 867 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  37.63 
 
 		 868 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  38.33 
 
 		 1265 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  33.59 
 
 		 1771 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  31.91 
 
 		 901 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.42 
 
 		 868 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3153  hypothetical protein  31.03 
 
 		 285 aa  55.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  37.89 
 
 		 746 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  41.77 
 
 		 833 aa  54.3  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  33.33 
 
 		 587 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  32.43 
 
 		 587 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  32.61 
 
 		 1104 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  32.61 
 
 		 1104 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 		 1217 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  32.43 
 
 		 553 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 863 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.38 
 
 		 868 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  32.43 
 
 		 587 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  32.43 
 
 		 587 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  31.91 
 
 		 902 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 604 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  32.77 
 
 		 1258 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  26.83 
 
 		 599 aa  50.4  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 772 aa  50.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1011 aa  50.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  30.09 
 
 		 950 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.36 
 
 		 944 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30 
 
 		 1426 aa  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  33.6 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  34.41 
 
 		 869 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  28.89 
 
 		 991 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.29 
 
 		 868 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  36.03 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  39.18 
 
 		 460 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  36.08 
 
 		 944 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  36.08 
 
 		 944 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  36.08 
 
 		 944 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  35.05 
 
 		 944 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  30.65 
 
 		 826 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  30.4 
 
 		 732 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  27.11 
 
 		 325 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  39.47 
 
 		 994 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  36.11 
 
 		 969 aa  45.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  31.25 
 
 		 989 aa  45.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.33 
 
 		 1011 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  26.37 
 
 		 743 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1022 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 		 1212 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  28.15 
 
 		 1098 aa  43.9  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  33.66 
 
 		 699 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1208 aa  43.9  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>