102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0889 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  44.65 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  36.19 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  33.67 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  32.66 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  33.33 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  28.5 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  33.09 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  30.32 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  26.06 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  29.02 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  29.47 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  29.17 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  30.71 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  29.37 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.33 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  30.15 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  26.57 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.03 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.17 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  35.77 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  25.64 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  31.52 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  27.69 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  24.15 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  25 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  27.5 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  35.2 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  23.53 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  24.56 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  29.6 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  39.24 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  28.86 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  24.26 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  28.86 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  23.08 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  34.44 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  22.64 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  32.52 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  37.97 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  30.33 
 
 		 284 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  30.68 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.63 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  31.76 
 
 		 269 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  32.17 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  34.11 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  32.26 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  32.18 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  24.12 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  33.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  25.33 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  31.71 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  31.71 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  34.18 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  33.59 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  28.64 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  28.72 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  36.07 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  31.63 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  28.83 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.98 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  25.56 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  28.46 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.5 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  30.97 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  31.4 
 
 		 289 aa  45.1  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  22.32 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  26.27 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.34 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  22.22 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  30.23 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  28.7 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  27.06 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  29.21 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  27.78 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  29.6 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  29.6 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  23.18 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  32.5 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0987  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.000000124238  decreased coverage  8.983340000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  25 
 
 		 289 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  25.56 
 
 		 238 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  24.02 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  25 
 
 		 289 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  35.37 
 
 		 209 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  29.01 
 
 		 248 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  23.88 
 
 		 289 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>