262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0678 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0678  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 547 aa  1131    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.906307  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0859  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.77 
 
 		 541 aa  347  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.509195  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0930  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.77 
 
 		 541 aa  346  7e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0395136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0992  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.89 
 
 		 541 aa  342  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0469572  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0107  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.33 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1378  putative soluble lytic murein transglycosylase  37.86 
 
 		 542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0440  putative soluble lytic murein transglycosylase  35.39 
 
 		 545 aa  320  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00101982  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0719  soluble lytic murein transglycosylase, SLT family  36.67 
 
 		 545 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.273339  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1546  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.83 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  31.74 
 
 		 197 aa  83.2  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  35.58 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  29.7 
 
 		 688 aa  80.1  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  33.14 
 
 		 729 aa  74.7  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.56 
 
 		 654 aa  73.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.93 
 
 		 669 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  34.52 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  33.12 
 
 		 616 aa  70.5  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  31.93 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  32.4 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  29.81 
 
 		 179 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  30.53 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  31.49 
 
 		 655 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  32.96 
 
 		 650 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  30.16 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  32.48 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  30.86 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  32.96 
 
 		 650 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 804 aa  68.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  30.97 
 
 		 777 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  31.72 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  31.07 
 
 		 731 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  29.88 
 
 		 193 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  29.01 
 
 		 199 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  29.94 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  33.89 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 760 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  30.63 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  29.88 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  31.1 
 
 		 709 aa  63.9  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 		 756 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  31.01 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  32.37 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  28.83 
 
 		 188 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  34.75 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  30.3 
 
 		 706 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  32.31 
 
 		 642 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 757 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  29.63 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  31.52 
 
 		 830 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  30.38 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 800 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  25.11 
 
 		 637 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 763 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  30.38 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  30.38 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  30.38 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  31.14 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  30.48 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.58 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  28.4 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  31.14 
 
 		 774 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  31.52 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  28.4 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  32.58 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  31.87 
 
 		 715 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  31.14 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  28.33 
 
 		 690 aa  60.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  31.68 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  29.88 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  28.07 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 730 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  28.07 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  28.07 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  31.48 
 
 		 603 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  27.33 
 
 		 195 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 650 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  30.43 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.43 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  33.57 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  30.38 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  29.45 
 
 		 735 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  26.25 
 
 		 798 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  30.38 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  30.38 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  31.06 
 
 		 650 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  27.4 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>