289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2375 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  100 
 
 		 2172 aa  4480    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 1055 aa  232  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  32.01 
 
 		 1042 aa  212  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  30.42 
 
 		 811 aa  205  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  27.73 
 
 		 1113 aa  202  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  35.12 
 
 		 422 aa  196  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  31.17 
 
 		 570 aa  186  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.6 
 
 		 396 aa  186  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.29 
 
 		 387 aa  180  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  33.97 
 
 		 371 aa  173  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.69 
 
 		 414 aa  172  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.78 
 
 		 450 aa  167  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.25 
 
 		 570 aa  159  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.88 
 
 		 451 aa  154  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.61 
 
 		 367 aa  153  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.93 
 
 		 427 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.79 
 
 		 455 aa  150  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  33.01 
 
 		 482 aa  150  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  29.28 
 
 		 667 aa  149  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  32.33 
 
 		 461 aa  147  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  33.72 
 
 		 676 aa  147  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.18 
 
 		 520 aa  145  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.08 
 
 		 403 aa  145  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  33.04 
 
 		 875 aa  145  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.35 
 
 		 392 aa  139  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.37 
 
 		 388 aa  139  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.64 
 
 		 388 aa  138  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.79 
 
 		 442 aa  135  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  29.64 
 
 		 818 aa  135  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  29.31 
 
 		 471 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  26.99 
 
 		 561 aa  130  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  27.36 
 
 		 919 aa  129  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  29.89 
 
 		 400 aa  129  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  32.69 
 
 		 419 aa  129  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  30.99 
 
 		 469 aa  125  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  32.05 
 
 		 518 aa  125  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.61 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.97 
 
 		 561 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  36.06 
 
 		 392 aa  111  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  28.16 
 
 		 387 aa  110  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  31.48 
 
 		 530 aa  110  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  27.27 
 
 		 766 aa  109  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  31.08 
 
 		 430 aa  109  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  28.92 
 
 		 382 aa  108  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  30.49 
 
 		 376 aa  108  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  33.65 
 
 		 381 aa  108  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.47 
 
 		 383 aa  108  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 386 aa  108  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.65 
 
 		 394 aa  108  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  28.57 
 
 		 383 aa  106  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32.56 
 
 		 1029 aa  105  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  28.99 
 
 		 778 aa  105  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 		 377 aa  105  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  33.49 
 
 		 374 aa  105  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  32.59 
 
 		 342 aa  104  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  26.28 
 
 		 868 aa  104  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.24 
 
 		 369 aa  103  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  30.96 
 
 		 1151 aa  103  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  31.56 
 
 		 382 aa  103  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  28.76 
 
 		 488 aa  103  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.22 
 
 		 809 aa  103  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  29.41 
 
 		 918 aa  102  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  30.5 
 
 		 1182 aa  102  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  28.72 
 
 		 475 aa  102  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 		 366 aa  102  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 377 aa  102  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  101  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 		 395 aa  102  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  28.66 
 
 		 378 aa  102  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  32.86 
 
 		 387 aa  101  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 		 381 aa  100  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  29.96 
 
 		 395 aa  100  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  31.84 
 
 		 748 aa  100  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 391 aa  99.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  29.08 
 
 		 388 aa  99.8  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  27.2 
 
 		 972 aa  99.8  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  29.31 
 
 		 388 aa  99.8  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  26.67 
 
 		 712 aa  99.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  33.22 
 
 		 387 aa  99.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.45 
 
 		 1657 aa  98.6  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  32.42 
 
 		 381 aa  99  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  27.14 
 
 		 395 aa  98.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  27.76 
 
 		 406 aa  97.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  31.96 
 
 		 383 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.42 
 
 		 585 aa  98.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  35.58 
 
 		 405 aa  97.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 		 382 aa  97.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  29.45 
 
 		 367 aa  97.1  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  29.91 
 
 		 392 aa  97.1  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.3 
 
 		 1200 aa  96.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.48 
 
 		 729 aa  96.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  27.21 
 
 		 984 aa  96.3  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  28.14 
 
 		 381 aa  95.9  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  27.63 
 
 		 410 aa  95.9  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  30.63 
 
 		 387 aa  95.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  30.88 
 
 		 1142 aa  95.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  26.19 
 
 		 428 aa  95.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  26.19 
 
 		 428 aa  94.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3219  glucose sorbosone dehydrogenase  35.5 
 
 		 359 aa  94.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  26.97 
 
 		 866 aa  94  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>