More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0795 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0795  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 793 aa  1635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1552  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 		 731 aa  150  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  40 
 
 		 680 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  39.49 
 
 		 678 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 715 aa  98.2  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 		 615 aa  94.7  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 680 aa  91.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  30.62 
 
 		 668 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 710 aa  88.6  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  34.72 
 
 		 676 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 		 643 aa  86.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 684 aa  86.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 645 aa  84.7  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  35.29 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  34.27 
 
 		 670 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 707 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  32.19 
 
 		 652 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  21.84 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 699 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1128 aa  80.9  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 681 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  34.75 
 
 		 702 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  34.04 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  30.26 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.74 
 
 		 667 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.46 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 688 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  29.34 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  29.02 
 
 		 718 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 675 aa  77.8  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.09 
 
 		 641 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.09 
 
 		 659 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.09 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.09 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.78 
 
 		 686 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.09 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.09 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.09 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 686 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  32.59 
 
 		 704 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 715 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  32 
 
 		 673 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 715 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 665 aa  77  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  32.59 
 
 		 704 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.89 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 671 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.89 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.89 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.89 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.56 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 689 aa  75.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  28.98 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  31.29 
 
 		 659 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.55 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 687 aa  74.7  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  31.16 
 
 		 671 aa  74.3  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  32.86 
 
 		 713 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 705 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 640 aa  73.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.57 
 
 		 833 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 679 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 714 aa  73.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 664 aa  73.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  29.92 
 
 		 653 aa  73.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 775 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  28.71 
 
 		 639 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 678 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 653 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 656 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 653 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 653 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.26 
 
 		 618 aa  72  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  26.21 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 783 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 652 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  28.1 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 653 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.51 
 
 		 656 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.65 
 
 		 1023 aa  70.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 679 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  28.4 
 
 		 666 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  28.23 
 
 		 666 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 751 aa  70.5  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 670 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>