More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4970 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  90.94 
 
 		 508 aa  904    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  100 
 
 		 504 aa  994    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  44.47 
 
 		 471 aa  289  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  40.94 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  40.23 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  37.7 
 
 		 442 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 523 aa  210  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  36.82 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 692 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  39.32 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  35.51 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2222  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 452 aa  190  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  34.67 
 
 		 442 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  35.55 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  32.38 
 
 		 478 aa  153  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 452 aa  150  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  31.87 
 
 		 477 aa  150  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 452 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.59 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  33.93 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  30 
 
 		 479 aa  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  34.01 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.87 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  33.85 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.42 
 
 		 444 aa  143  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  31.61 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  35.13 
 
 		 449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  33.87 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  32.51 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  33.6 
 
 		 469 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  34.24 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.43 
 
 		 447 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 447 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  34.86 
 
 		 455 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  31.44 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  33.15 
 
 		 594 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.05 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.72 
 
 		 472 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.35 
 
 		 624 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  35.43 
 
 		 446 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  34.24 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  34.24 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  34.01 
 
 		 638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  32.47 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.89 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  35.14 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  35.14 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  35.14 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  33.52 
 
 		 634 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  31.19 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  32.07 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  33.07 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  31.54 
 
 		 513 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32.28 
 
 		 440 aa  130  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  32.38 
 
 		 417 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  34.59 
 
 		 438 aa  130  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  29.68 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  30.85 
 
 		 465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  31.58 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  29.57 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  33.72 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  33.72 
 
 		 444 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  32.66 
 
 		 423 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  32.87 
 
 		 474 aa  128  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.19 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  32.6 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  30.15 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  31.25 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.09 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  30.25 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  31.48 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.88 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  32.51 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  30.16 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 608 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  30.46 
 
 		 491 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  30.86 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 442 aa  123  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  33.13 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  31.61 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.02 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  32.39 
 
 		 639 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  31.75 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>