133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1834 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  34.65 
 
 		 2046 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  32.64 
 
 		 2113 aa  727    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2038 aa  4145    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  33.05 
 
 		 2585 aa  396  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  29.81 
 
 		 1531 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1101 aa  335  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.83 
 
 		 1147 aa  217  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1164 aa  211  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  28.34 
 
 		 1037 aa  184  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  26.88 
 
 		 948 aa  166  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  27.57 
 
 		 958 aa  165  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  36.26 
 
 		 451 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  35.91 
 
 		 577 aa  133  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1375 aa  132  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  27.54 
 
 		 2447 aa  105  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1931 aa  104  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  34.72 
 
 		 714 aa  99  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  36.32 
 
 		 508 aa  95.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.18 
 
 		 456 aa  88.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  31.25 
 
 		 2031 aa  86.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.16 
 
 		 2096 aa  84.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  25.53 
 
 		 2215 aa  78.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  24.91 
 
 		 2224 aa  68.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  23.91 
 
 		 2224 aa  68.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  23.91 
 
 		 2224 aa  68.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  21.66 
 
 		 1840 aa  68.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1209 aa  66.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.1 
 
 		 3027 aa  63.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  22.74 
 
 		 1976 aa  62.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1547 aa  62.4  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  25.19 
 
 		 6272 aa  61.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  26.35 
 
 		 1308 aa  60.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  26.35 
 
 		 1388 aa  60.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.23 
 
 		 1560 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1520 aa  58.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1527 aa  58.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1551 aa  58.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1942 aa  58.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  26.62 
 
 		 1377 aa  57.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  26.62 
 
 		 1411 aa  57.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.5 
 
 		 1917 aa  58.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 3273 aa  57.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  26.62 
 
 		 1397 aa  57.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  26.62 
 
 		 1411 aa  58.2  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1377 aa  58.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1411 aa  57.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1397 aa  58.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  26.69 
 
 		 1399 aa  58.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  23.08 
 
 		 2225 aa  58.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  26.62 
 
 		 1411 aa  57.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1411 aa  57.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  26.35 
 
 		 1411 aa  57.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 3073 aa  57.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  26.69 
 
 		 1409 aa  57.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.68 
 
 		 2149 aa  57.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  26.69 
 
 		 1397 aa  57  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1317 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  22.97 
 
 		 1614 aa  57  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  27 
 
 		 1397 aa  57  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  27 
 
 		 1365 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  26.69 
 
 		 1394 aa  56.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  23.27 
 
 		 2246 aa  55.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  27.34 
 
 		 2138 aa  55.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  22.69 
 
 		 2221 aa  54.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.85 
 
 		 1539 aa  54.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 628 aa  55.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.3 
 
 		 1485 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  22.65 
 
 		 2191 aa  53.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  27.21 
 
 		 1400 aa  54.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  21.76 
 
 		 1669 aa  53.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  25.85 
 
 		 1539 aa  53.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.64 
 
 		 3689 aa  53.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  40 
 
 		 2003 aa  53.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  24.27 
 
 		 2387 aa  53.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  23.83 
 
 		 765 aa  53.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.81 
 
 		 2277 aa  53.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.95 
 
 		 1576 aa  53.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1197 aa  52.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  23.86 
 
 		 1953 aa  52.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  27.21 
 
 		 1426 aa  52.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.3 
 
 		 1572 aa  52.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1426 aa  52.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1268 aa  52.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  20 
 
 		 2178 aa  52.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.18 
 
 		 1595 aa  52  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1216 aa  52  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  27.21 
 
 		 1200 aa  51.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.18 
 
 		 1586 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.04 
 
 		 1508 aa  51.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  20.94 
 
 		 1352 aa  51.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  24.78 
 
 		 2652 aa  51.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  26.97 
 
 		 1405 aa  51.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  24.39 
 
 		 1008 aa  51.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  24.39 
 
 		 1008 aa  51.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  26.46 
 
 		 1410 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1149 aa  50.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  23.48 
 
 		 741 aa  50.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.04 
 
 		 1271 aa  49.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  36.36 
 
 		 2497 aa  49.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1600 aa  49.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>