113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1405 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 418 aa  822    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  37.97 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  37.22 
 
 		 416 aa  239  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 		 421 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  36.46 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  34.13 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  33.24 
 
 		 431 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  36.13 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  30.6 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 		 419 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  30.97 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  30.97 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  30.97 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  30.97 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  30.97 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  30.97 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  30.97 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  30.24 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  29.93 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 418 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.41 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  33.96 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  29.66 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  25.83 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 431 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 426 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  26.91 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  28.36 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.88 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  28.93 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 485 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  27.43 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  27.4 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.46 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  24.91 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  24.91 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  23 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.42 
 
 		 483 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1027  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.18 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 502 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  20.89 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  17.81 
 
 		 494 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 484 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  25.36 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  35.96 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  24.65 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  17.38 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  24.91 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  21.02 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  21.43 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  31.25 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>