More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0686 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  55.07 
 
 		 213 aa  218  6e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  47.87 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  45.45 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  45.02 
 
 		 228 aa  187  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  49.28 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  44.76 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  43.54 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  44.66 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  41.26 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  44.81 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  43.17 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  42.79 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.61 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.05 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  47.03 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  41.75 
 
 		 228 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  41.75 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  45.37 
 
 		 220 aa  167  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  40.57 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  39.81 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  42.93 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  42.52 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  43.46 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.7 
 
 		 254 aa  165  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  40.29 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  40.2 
 
 		 221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  44.5 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  42.58 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  38.86 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  41.4 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  36.41 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  39.13 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  39.13 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  40.87 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  47.98 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  39.61 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.87 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  36.14 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  38.79 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  35.86 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  38.33 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  36.77 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.5 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.17 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  36.96 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  31.53 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  36.59 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  29.91 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  34.78 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  30.43 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  34.83 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  28.82 
 
 		 296 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  38.71 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  27.83 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  36.13 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  33.69 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  33.69 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  29.25 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  30.92 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  36.19 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.2 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  36.36 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  35.87 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  36.19 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  32.29 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  35.24 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  33.69 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.61 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  31.38 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  29.29 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  28.3 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.46 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.11 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  34.04 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.79 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.87 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  30.27 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  27.95 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  30.21 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  27.23 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  29.25 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  30.39 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  34.53 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.99 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  27.01 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  27.88 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  28.34 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.16 
 
 		 356 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25.56 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  25 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  30.83 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.98 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  24.39 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  29.17 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.33 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  27.96 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.16 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  27.42 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>