More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1846 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  46.42 
 
 		 1136 aa  920    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  49.41 
 
 		 774 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1170 aa  2386    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.71 
 
 		 1212 aa  1129    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  51.14 
 
 		 1170 aa  1127    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  49.41 
 
 		 1170 aa  1071    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  57.25 
 
 		 1160 aa  1293    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  49.28 
 
 		 1169 aa  1080    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  51.02 
 
 		 1160 aa  1098    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  46.76 
 
 		 906 aa  763    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  52.65 
 
 		 1194 aa  1173    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  54.06 
 
 		 1172 aa  1214    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  46.6 
 
 		 760 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  47.21 
 
 		 1137 aa  928    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  52.91 
 
 		 829 aa  781    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  81.28 
 
 		 1167 aa  1930    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  53.57 
 
 		 1168 aa  1219    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  81.34 
 
 		 1167 aa  1932    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  52.07 
 
 		 1170 aa  1184    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  49.87 
 
 		 1172 aa  1157    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  49.28 
 
 		 1169 aa  1077    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  81.12 
 
 		 1167 aa  1917    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  42.14 
 
 		 964 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  48.41 
 
 		 814 aa  548  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  61.2 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  35.62 
 
 		 1129 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.58 
 
 		 1116 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  32.23 
 
 		 1138 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1144 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.91 
 
 		 1145 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  40.74 
 
 		 1131 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.53 
 
 		 1147 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.9 
 
 		 835 aa  392  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  69.18 
 
 		 283 aa  363  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  37.07 
 
 		 1062 aa  363  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  40.14 
 
 		 565 aa  345  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.12 
 
 		 988 aa  310  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  31.37 
 
 		 971 aa  280  9e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  31.71 
 
 		 969 aa  266  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  50.19 
 
 		 312 aa  253  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.95 
 
 		 933 aa  249  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  30.97 
 
 		 922 aa  247  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.38 
 
 		 925 aa  247  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  31.75 
 
 		 1069 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 1069 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  31.55 
 
 		 969 aa  245  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32.69 
 
 		 941 aa  241  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32.69 
 
 		 941 aa  241  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.26 
 
 		 927 aa  241  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  33.13 
 
 		 966 aa  239  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.82 
 
 		 962 aa  234  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.33 
 
 		 972 aa  233  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.86 
 
 		 801 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.53 
 
 		 919 aa  227  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 877 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.45 
 
 		 894 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.85 
 
 		 805 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.9 
 
 		 937 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.22 
 
 		 952 aa  215  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 1031 aa  207  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 1046 aa  201  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.08 
 
 		 1045 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 		 1058 aa  194  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  29.33 
 
 		 1177 aa  190  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.16 
 
 		 1049 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.91 
 
 		 900 aa  188  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  30.2 
 
 		 1082 aa  187  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.06 
 
 		 1057 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.53 
 
 		 1095 aa  183  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.28 
 
 		 1028 aa  179  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  28.76 
 
 		 940 aa  177  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  30.69 
 
 		 1044 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.09 
 
 		 961 aa  174  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.62 
 
 		 1165 aa  173  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.6 
 
 		 933 aa  170  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.05 
 
 		 584 aa  170  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.8 
 
 		 1201 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 		 1201 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.31 
 
 		 560 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.42 
 
 		 954 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 1013 aa  166  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  27.17 
 
 		 949 aa  164  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  28.21 
 
 		 1038 aa  161  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.17 
 
 		 941 aa  161  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.02 
 
 		 584 aa  160  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  29.56 
 
 		 964 aa  159  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.18 
 
 		 961 aa  159  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.6 
 
 		 960 aa  159  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 948 aa  158  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  26.89 
 
 		 951 aa  157  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  33.23 
 
 		 346 aa  157  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.13 
 
 		 955 aa  157  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  30.15 
 
 		 973 aa  156  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.63 
 
 		 555 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  27.83 
 
 		 952 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  28.29 
 
 		 1094 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  28.34 
 
 		 932 aa  153  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.85 
 
 		 942 aa  153  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  27.64 
 
 		 952 aa  152  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  27.64 
 
 		 952 aa  152  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>