233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1174 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 324 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  95.68 
 
 		 324 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  90.12 
 
 		 324 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  66.98 
 
 		 331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  67.92 
 
 		 324 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  57.54 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  54.49 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  54.74 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  54.46 
 
 		 321 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  54.15 
 
 		 326 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  55.21 
 
 		 324 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  53.47 
 
 		 331 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  50.79 
 
 		 323 aa  325  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  50.94 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  54.46 
 
 		 332 aa  319  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  53.85 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  50.48 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  50.32 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  50.32 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  50 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  50 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  50 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  50.15 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  50.63 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  49.36 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  49.36 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  49.2 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  49.2 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  49.2 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  48.87 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  48.87 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  48.87 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  39.3 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  38.94 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  35.88 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  38.91 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.64 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.33 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  30.88 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.63 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  27.83 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  39.16 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  25.33 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  25.33 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  25.33 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  25.33 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  30.06 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  26.39 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  27.43 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.91 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  31.82 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.72 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.08 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  29.48 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  28.22 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30.72 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  33.56 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  25.27 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.14 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  29.88 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  27.02 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  24.28 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  28.98 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  28.98 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  28.09 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  26.47 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.98 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  32.08 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  29.79 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  29.68 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  28.98 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27.68 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  31.54 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.55 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.24 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  30.07 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.13 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  29.11 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.21 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  30.14 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.38 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  28.98 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  28.98 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  28.3 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  27.96 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  26.22 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  31.54 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  32.64 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  33.33 
 
 		 597 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  27.74 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  28.66 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  29.94 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  30.2 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  30.2 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  30.2 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  28.03 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>