224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4256 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 366 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 375 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.67 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.6 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.56 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  30.65 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  23.27 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  21.72 
 
 		 360 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.12 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 279 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.69 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 378 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.39 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.24 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  26.42 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  26.17 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  27.27 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 388 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 384 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  25.5 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 413 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 		 327 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.37 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 		 356 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 284 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.99 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 325 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.31 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  25.99 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.42 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  27.14 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  28.7 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  28.7 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.5 
 
 		 359 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  29.68 
 
 		 382 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  28.7 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  28.7 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  28.7 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  28.7 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  28.7 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 366 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 304 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  46.43 
 
 		 358 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  46.43 
 
 		 359 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  24.74 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.49 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  46.43 
 
 		 359 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  46.43 
 
 		 359 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  22.8 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>