More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3977 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  80.4 
 
 		 255 aa  400  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.1 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.51 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  23.77 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  23.77 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.84 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.89 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  23.89 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  35.77 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  23.48 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  29.96 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  40.57 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  37.19 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  24.59 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  37.82 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  43.56 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  23.48 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30.22 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  28.76 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.07 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.88 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  31.51 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.58 
 
 		 583 aa  65.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.21 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  33.61 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  40 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.54 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.75 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.42 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.11 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.93 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  23.74 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.57 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  33.56 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  26.03 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  23.74 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  27.13 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  25.82 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.92 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.04 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  24.79 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  28.87 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  24.79 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  22.27 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  29.34 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  39.76 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  36.04 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  38.64 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  36.84 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  23.51 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  35.34 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.74 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.81 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  25.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  23.61 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.25 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  22.27 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  28.46 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.8 
 
 		 543 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0945  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.78 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  33.58 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.06 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  24.59 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  33.58 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  38.54 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  25.11 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  25.6 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  42.11 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  29.15 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  22.27 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  30.49 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  32.99 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  21.9 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  30 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  24.8 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  35.85 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  24.11 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.54 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.48 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  33.98 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.82 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  34.68 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>