287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5086 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  771    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  75.84 
 
 		 386 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  68.73 
 
 		 389 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  64.32 
 
 		 381 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  63.34 
 
 		 375 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  62.37 
 
 		 375 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  60.59 
 
 		 375 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  58.6 
 
 		 378 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  58.06 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  59.03 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  57.95 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 		 379 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  55.5 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  55.26 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  55.67 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  54.99 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  54.38 
 
 		 385 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  43.58 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  41.89 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  42.18 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  43.06 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  40.88 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.75 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 812 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.27 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25.11 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 823 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  24.2 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 799 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  22.8 
 
 		 503 aa  66.2  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  27.3 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.71 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  25.66 
 
 		 831 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  26.86 
 
 		 831 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 831 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 806 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  20.81 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  21.1 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  22.64 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 494 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 837 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  24.48 
 
 		 831 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>