270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4372 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  70.35 
 
 		 201 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 198 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 198 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  38.21 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 269 aa  124  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 342 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 195 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  35.16 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  39.56 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  23.97 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  28.85 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 184 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 191 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.85 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 190 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>