64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2319 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  100 
 
 		 1106 aa  2224    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  33.55 
 
 		 799 aa  171  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.5 
 
 		 852 aa  155  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  32.64 
 
 		 1092 aa  145  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  42.29 
 
 		 1332 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  36.26 
 
 		 507 aa  127  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  38.65 
 
 		 417 aa  121  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1010 aa  118  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  37.21 
 
 		 441 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  37.7 
 
 		 2192 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  39.39 
 
 		 350 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  45.45 
 
 		 362 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  39.86 
 
 		 1296 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  29.31 
 
 		 775 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1263 aa  88.6  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  32.03 
 
 		 717 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  35.38 
 
 		 1526 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  39.42 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  48 
 
 		 149 aa  82  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  29.92 
 
 		 1216 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  30.41 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  26.81 
 
 		 743 aa  74.7  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1055 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  24.95 
 
 		 541 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  29.89 
 
 		 545 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  29.91 
 
 		 593 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  36.75 
 
 		 5453 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  30.8 
 
 		 1170 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1318 aa  71.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  31.17 
 
 		 558 aa  64.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  27.04 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  25.3 
 
 		 601 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  30.2 
 
 		 844 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.52 
 
 		 1755 aa  56.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  25.66 
 
 		 461 aa  55.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  42.55 
 
 		 595 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.27 
 
 		 575 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  34.34 
 
 		 679 aa  52.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1162 aa  51.2  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  44.44 
 
 		 966 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1123 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  31.16 
 
 		 731 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1270 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0693  polymorphic membrane protein A family protein  34.75 
 
 		 986 aa  48.9  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  33.78 
 
 		 689 aa  48.5  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  23.86 
 
 		 466 aa  47.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  28.25 
 
 		 526 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  37.27 
 
 		 685 aa  48.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  32.35 
 
 		 516 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  34.34 
 
 		 997 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  24.07 
 
 		 450 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  25.3 
 
 		 464 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  32.91 
 
 		 520 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  38.04 
 
 		 554 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  23.39 
 
 		 659 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 797 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  23.17 
 
 		 459 aa  46.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.05 
 
 		 1797 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  24.46 
 
 		 591 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  29.5 
 
 		 483 aa  45.8  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  32.29 
 
 		 990 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1010 aa  44.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  25.84 
 
 		 454 aa  44.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>