68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0652 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  60.67 
 
 		 553 aa  656    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  100 
 
 		 565 aa  1161    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  50.18 
 
 		 548 aa  569  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  54.73 
 
 		 690 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  51.12 
 
 		 575 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  51.32 
 
 		 576 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  45.98 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  50.74 
 
 		 549 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  48.69 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  45.98 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  50.27 
 
 		 560 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  49.16 
 
 		 574 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  48.36 
 
 		 596 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  48.96 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  48.58 
 
 		 568 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  47.12 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  47.54 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  47.86 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  41.99 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  26.2 
 
 		 542 aa  173  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  27.27 
 
 		 546 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  27.34 
 
 		 504 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  27.31 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  26.93 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  26.76 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  27.17 
 
 		 527 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  27.41 
 
 		 525 aa  144  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  28.01 
 
 		 484 aa  144  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  25.96 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  26.43 
 
 		 547 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  25.64 
 
 		 566 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  27.1 
 
 		 493 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  26.51 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  27.09 
 
 		 519 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  26.57 
 
 		 493 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  24.77 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  22.85 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  22.94 
 
 		 557 aa  91.7  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  25.13 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  23.9 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  24.14 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  25.54 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  23.1 
 
 		 400 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  22.69 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  25.54 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  22.83 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  24.69 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  23.99 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  25.2 
 
 		 391 aa  57  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  22 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  22 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  23.98 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  21.43 
 
 		 397 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  22.73 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  38.64 
 
 		 154 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  37.5 
 
 		 121 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 143 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  40 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  28.4 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  32.23 
 
 		 110 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.11 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.78 
 
 		 723 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1984  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 		 464 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  34.74 
 
 		 110 aa  44.3  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.25 
 
 		 293 aa  43.9  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1963  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.48 
 
 		 299 aa  43.9  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  30.43 
 
 		 123 aa  43.9  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 153 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>