156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1910 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  100 
 
 		 404 aa  821    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  99.75 
 
 		 404 aa  819    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  70.9 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  63.93 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  61.73 
 
 		 390 aa  504  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  64.29 
 
 		 402 aa  504  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  61.96 
 
 		 387 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  58.14 
 
 		 391 aa  484  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  56.07 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  57.68 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  58.65 
 
 		 392 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  58.65 
 
 		 392 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  56.37 
 
 		 384 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  54.28 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0342  cytochrome d1 heme region  30.37 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00493311  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1988  nitrite reductase NirF  26.04 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  28.88 
 
 		 504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  28.73 
 
 		 493 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  28.73 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0458  cytochrome d1 heme region  24.36 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000480254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  26.18 
 
 		 542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  30.05 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  27.93 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  25.45 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  27.43 
 
 		 517 aa  103  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  26.47 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  27.79 
 
 		 527 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  27.98 
 
 		 566 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  27.98 
 
 		 542 aa  97.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  24.93 
 
 		 503 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  27.23 
 
 		 525 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  26.93 
 
 		 547 aa  93.2  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  24.74 
 
 		 528 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  25.32 
 
 		 542 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1667 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  30.84 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.15 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.45 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 776 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.12 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  24.14 
 
 		 819 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.44 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.39 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.36 
 
 		 479 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  24.3 
 
 		 810 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.6 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  24.86 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  25.12 
 
 		 690 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.24 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.29 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.29 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5257  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.8 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.73 
 
 		 580 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26.13 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.48 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.45 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.94 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.94 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.94 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.02 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.89 
 
 		 1094 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.87 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5399  hypothetical protein  25.55 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.18 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  24.45 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.65 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.42 
 
 		 556 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.61 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.64 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.1 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.01 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.15 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.84 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  24.5 
 
 		 332 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.88 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.31 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.98 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.52 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.7 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  21.41 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  26.71 
 
 		 541 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.21 
 
 		 338 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  33.91 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  26.71 
 
 		 538 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  18.67 
 
 		 556 aa  53.5  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.57 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.32 
 
 		 943 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.1 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  31.43 
 
 		 640 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1984  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.51 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.11 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.79 
 
 		 752 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.85 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2448  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.05 
 
 		 658 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.85 
 
 		 357 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  22.38 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  23.06 
 
 		 553 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  24.49 
 
 		 971 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.82 
 
 		 325 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>