236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1984 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1984  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
464 aa  937    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.584863  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.44 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.44 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.76 
 
 
492 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3795  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.01 
 
 
493 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3857  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  50.82 
 
 
491 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.337785  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5257  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.56 
 
 
478 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4934  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  50.82 
 
 
491 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  50.94 
 
 
479 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5399  hypothetical protein  50.83 
 
 
500 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.86 
 
 
1667 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  30.43 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.87 
 
 
353 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.82 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.41 
 
 
354 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.58 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.95 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.79 
 
 
689 aa  97.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.52 
 
 
317 aa  96.3  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.84 
 
 
1094 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  28.13 
 
 
335 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.97 
 
 
366 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  28.92 
 
 
819 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  27.88 
 
 
580 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  29.11 
 
 
479 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.24 
 
 
329 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.45 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.82 
 
 
354 aa  89.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.52 
 
 
312 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.16 
 
 
348 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  28.48 
 
 
391 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.12 
 
 
974 aa  86.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.05 
 
 
347 aa  86.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.51 
 
 
415 aa  86.7  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.15 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.15 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.15 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.15 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.13 
 
 
517 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  31.91 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.62 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 
344 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 
776 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.01 
 
 
810 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.27 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  25.57 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.69 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.84 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.43 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.74 
 
 
324 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.96 
 
 
457 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.04 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  27.07 
 
 
556 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.55 
 
 
752 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.47 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.76 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.27 
 
 
320 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  26.17 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.71 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.4 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  24.7 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.26 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.92 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.72 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.46 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.53 
 
 
383 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.87 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.07 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.37 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  28.21 
 
 
971 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.07 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.17 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.55 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.95 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.75 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.88 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.27 
 
 
943 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.84 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.66 
 
 
362 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.24 
 
 
332 aa  67  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.66 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  26.02 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  28.62 
 
 
306 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.66 
 
 
362 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.66 
 
 
362 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  22.83 
 
 
306 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.33 
 
 
316 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.22 
 
 
305 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.47 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  27.39 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  24.06 
 
 
445 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  25.2 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1118  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.65 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 
324 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.1 
 
 
345 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.46 
 
 
320 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  27.13 
 
 
330 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.62 
 
 
329 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>