181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4714 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4714  putative transcriptional regulator protein, ROK family  100 
 
 		 379 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  89.01 
 
 		 379 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7332  Transcriptional regulator/sugar kinase  34.28 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.93 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.11 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.91 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  27.7 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  27.93 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1899  ROK  25.56 
 
 		 409 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  25.94 
 
 		 404 aa  92.8  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  26.7 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  26.32 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  25.27 
 
 		 397 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  26.26 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  25.08 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  22.85 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  24.05 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.34 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  25.74 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  25.72 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  25.82 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  25.84 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  24.92 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  24.33 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  24.71 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  24 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  24.37 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  24 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.1 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  25.6 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  25.77 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  25.51 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  27.69 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  24.44 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  24.27 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  26.76 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  25.14 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  23.65 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.69 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  25.96 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  24.51 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  25.74 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  23.46 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
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NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  24.68 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  24.89 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  25.77 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  24.24 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  21.95 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  23.97 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  24.31 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
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NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  24.31 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  24.31 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  24.41 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  26.36 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  23.34 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  24.03 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  24.72 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  24.46 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  28.57 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  26.45 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  26.1 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  22.92 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  21.6 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  40 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  24.56 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  24.52 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  21.6 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  25.11 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  21.03 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  23.83 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  27.85 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  25.98 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  25.78 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.04 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  20.66 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  26.89 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  21.14 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  33.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  36.36 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
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NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  23.79 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  27.61 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  23.48 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
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NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  23.58 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  23.27 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  23.69 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  22.54 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  22.8 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  20.32 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  35.05 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578503 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  25.93 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  22.18 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  19.85 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1118  ROK familiy protein  20.38 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP2517  xylose repressor  18.98 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  18.98 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  18.98 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02406  hypothetical protein  20.38 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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