More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3914 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  100 
 
 
622 aa  1237    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  94.05 
 
 
622 aa  1180    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  59.25 
 
 
620 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  63.18 
 
 
637 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  39.12 
 
 
643 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  38.01 
 
 
671 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  38.57 
 
 
639 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  38.41 
 
 
639 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  34.34 
 
 
665 aa  318  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  36.36 
 
 
653 aa  317  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  35.29 
 
 
663 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  32.31 
 
 
653 aa  292  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  31.38 
 
 
653 aa  292  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  32.33 
 
 
677 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  33.13 
 
 
661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  33.39 
 
 
661 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  33.23 
 
 
652 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  32.71 
 
 
661 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  31.24 
 
 
627 aa  253  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  30.43 
 
 
647 aa  250  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  33.28 
 
 
632 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  30.98 
 
 
598 aa  244  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.36 
 
 
702 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  32.43 
 
 
610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  34.97 
 
 
615 aa  233  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  29.74 
 
 
594 aa  227  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  30.83 
 
 
789 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  29.41 
 
 
595 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  31.61 
 
 
607 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  31.43 
 
 
607 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  29.73 
 
 
627 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  30.04 
 
 
674 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  33.48 
 
 
776 aa  213  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.56 
 
 
595 aa  210  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  30.54 
 
 
709 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  31.52 
 
 
571 aa  196  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  27.41 
 
 
593 aa  196  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  29.08 
 
 
633 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.25 
 
 
670 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  31.72 
 
 
779 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  26.07 
 
 
613 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  28.01 
 
 
588 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  27.29 
 
 
610 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  27.36 
 
 
576 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  27.36 
 
 
618 aa  150  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.38 
 
 
579 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  25.56 
 
 
579 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  24.52 
 
 
555 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  25.41 
 
 
575 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.57 
 
 
752 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  26.56 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.6 
 
 
770 aa  127  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.1 
 
 
574 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.75 
 
 
583 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  23.53 
 
 
607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.81 
 
 
806 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.63 
 
 
793 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  25 
 
 
575 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.6 
 
 
583 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  23.28 
 
 
574 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.63 
 
 
793 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  25.92 
 
 
677 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  24.54 
 
 
583 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.96 
 
 
820 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  25.76 
 
 
677 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  24.21 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.41 
 
 
765 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  25.56 
 
 
893 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  24.69 
 
 
573 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  27.12 
 
 
596 aa  114  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  23.97 
 
 
779 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  27.5 
 
 
777 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.2 
 
 
920 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  26.43 
 
 
605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  25.82 
 
 
573 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  25.82 
 
 
573 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  25.82 
 
 
573 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27 
 
 
888 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  25.55 
 
 
611 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  26.23 
 
 
571 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0699  surface antigen (D15)  25.04 
 
 
1083 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.208817  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  25.55 
 
 
611 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  25.43 
 
 
778 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  26.23 
 
 
605 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  27.23 
 
 
835 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.24 
 
 
795 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.9 
 
 
892 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.24 
 
 
795 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  24.59 
 
 
582 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.24 
 
 
795 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  26.02 
 
 
605 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.06 
 
 
752 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.22 
 
 
895 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  25.96 
 
 
611 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  26.47 
 
 
646 aa  106  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  26.45 
 
 
604 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  26.28 
 
 
604 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  26.28 
 
 
604 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  26.43 
 
 
578 aa  104  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  25.25 
 
 
604 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>