82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3810 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
175 aa  347  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  91.43 
 
 
175 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  53.24 
 
 
152 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
163 aa  84.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  36.09 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
313 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  31.46 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
340 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
340 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
172 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
326 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  35.53 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
156 aa  48.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 
178 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  25 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
349 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  22.52 
 
 
283 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 
157 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  24.86 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
347 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.71 
 
 
349 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
150 aa  44.7  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
309 aa  44.7  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
149 aa  44.7  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
347 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  26.83 
 
 
140 aa  44.3  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
352 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
320 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  25.2 
 
 
312 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
334 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  22.45 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  30.21 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  27.78 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  27.78 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
165 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
145 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 
187 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
155 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  23 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  24.71 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  24.71 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
310 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
160 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
144 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  21.31 
 
 
171 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  40.8  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>