More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4453 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  60.71 
 
 		 591 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  68.17 
 
 		 575 aa  793    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  100 
 
 		 592 aa  1206    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  68.64 
 
 		 576 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  68.29 
 
 		 576 aa  802    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  72.92 
 
 		 579 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  39.3 
 
 		 579 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  39.13 
 
 		 576 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  39.93 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  39.44 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  40.98 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  40.82 
 
 		 576 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  39.41 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  33.2 
 
 		 534 aa  253  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  34.27 
 
 		 525 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  31.22 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  32.86 
 
 		 578 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  33.2 
 
 		 533 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  33.27 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  32.8 
 
 		 533 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  32.58 
 
 		 547 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  30.59 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  32.16 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  31.32 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  28.83 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  31.53 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  29.85 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  29.69 
 
 		 469 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  27.74 
 
 		 465 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  28.2 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  28.47 
 
 		 465 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  29 
 
 		 468 aa  172  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  27.61 
 
 		 471 aa  171  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  30.08 
 
 		 467 aa  170  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  26.95 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  29.69 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  29.93 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  28.98 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  28.39 
 
 		 468 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  28.74 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  26.92 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  29.08 
 
 		 468 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  28.74 
 
 		 468 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  27.71 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  26.69 
 
 		 470 aa  160  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  29.17 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  25.77 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  26.28 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.45 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  25.42 
 
 		 464 aa  145  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  25.25 
 
 		 473 aa  143  9e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  24.7 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  26.67 
 
 		 476 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  37.9 
 
 		 237 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  27.38 
 
 		 481 aa  128  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  27.77 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.72 
 
 		 345 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  24.84 
 
 		 469 aa  124  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  26.29 
 
 		 449 aa  123  8e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  25.74 
 
 		 481 aa  123  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  26.03 
 
 		 469 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  26.03 
 
 		 469 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  27.07 
 
 		 473 aa  121  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  26.75 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  26.25 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.11 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  22.9 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  29.78 
 
 		 280 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6159  peptidase M20  31.98 
 
 		 437 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.757625  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  33 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  29.05 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  31.66 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  32.09 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  37.24 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  28.81 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  28.09 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  30.13 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  34.62 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.96 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  37.35 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  35.88 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  33.79 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  30.52 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  38 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  34.85 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  28.34 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.76 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.93 
 
 		 414 aa  57  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.38 
 
 		 405 aa  57  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  30.52 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  38.3 
 
 		 422 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.61 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1489  peptidase M20  38.14 
 
 		 432 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0188879  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.25 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  32 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  37.23 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  23.41 
 
 		 411 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.65 
 
 		 487 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0954  peptidase dimerisation domain protein  28.57 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>