279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05071 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05071  putative outer membrane efflux transmembrane protein  100 
 
 		 483 aa  959    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485043  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3710  outer membrane efflux protein  74.59 
 
 		 564 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.14 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.1 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.68 
 
 		 469 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  27.69 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  27.06 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.42 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.45 
 
 		 469 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.82 
 
 		 478 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.02 
 
 		 478 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  27.96 
 
 		 459 aa  90.1  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.27 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.23 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0375  Outer membrane protein-like  24.61 
 
 		 667 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  23.8 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.06 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.11 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  23.8 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.58 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.47 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.98 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  21.03 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  21.17 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3147  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.71 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  21.63 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.19 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  22.28 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.51 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.51 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.12 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.54 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.15 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.67 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 431 aa  67  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.38 
 
 		 455 aa  67  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.86 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.59 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.97 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.54 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.82 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  20.74 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.48 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.6 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  20.54 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.56 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.65 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.34 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.41 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5748  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.41 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.61 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  20.37 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2411  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.562073  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.87 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.81 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.87 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.67 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.85 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.57 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.12 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.12 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.53 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  27.29 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  24.4 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.72 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.02 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.3 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.33 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.47 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2990  outer membrane efflux protein  21.22 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000136016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.47 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.44 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.77 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.1 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.1 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  26.65 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.1 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2845  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.05 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.31 
 
 		 658 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.25 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  27.44 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.2 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  22.25 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.68 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.86 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  24.1 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.56 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  18.09 
 
 		 566 aa  57  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0630  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.85 
 
 		 569 aa  57  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00465168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.15 
 
 		 483 aa  57  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>