More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0044 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  34.14 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  33.18 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  30.28 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  34.56 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  28.78 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  31.84 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  30.35 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  27.62 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  29.11 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  28 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  29.57 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.97 
 
 		 449 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.49 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.23 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.51 
 
 		 862 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.73 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  28.44 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  27.98 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.32 
 
 		 866 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  29.25 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28.22 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  26.4 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.17 
 
 		 349 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  23.11 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  28.4 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.28 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.8 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.62 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  31.84 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.8 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  28.4 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.66 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  26.58 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  30.48 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 872 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  31.29 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  29.81 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  24.04 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  26.6 
 
 		 710 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  25.76 
 
 		 389 aa  68.6  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  34.07 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 199 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  28.3 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  27.87 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  23.04 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  24.78 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  26.89 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  25.11 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  27.3 
 
 		 870 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  32.09 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  24.52 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.64 
 
 		 976 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  30.8 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 		 949 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  25.34 
 
 		 493 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  25.45 
 
 		 483 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  26.21 
 
 		 489 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  26.94 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  29.7 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.29 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  25.29 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  27.36 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.43 
 
 		 872 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  27.16 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.55 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.34 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  29.72 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  27.35 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  28.06 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.69 
 
 		 844 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  25.78 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  27.56 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  28.1 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  24.71 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.36 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  31.12 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  26.4 
 
 		 881 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  29.55 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  32.08 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>