More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1781 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  70.75 
 
 		 897 aa  1348    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  45.44 
 
 		 913 aa  720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  93.26 
 
 		 772 aa  1504    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  100 
 
 		 906 aa  1858    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  70.32 
 
 		 913 aa  1340    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  45.35 
 
 		 913 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  68.74 
 
 		 884 aa  1296    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 831 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  35.41 
 
 		 914 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  34.67 
 
 		 915 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.35 
 
 		 814 aa  429  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  33.07 
 
 		 857 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  32.95 
 
 		 866 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  33.06 
 
 		 870 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  30.68 
 
 		 823 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  31.56 
 
 		 887 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  31.98 
 
 		 832 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  31.44 
 
 		 836 aa  364  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  31.79 
 
 		 851 aa  359  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.85 
 
 		 820 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  30.57 
 
 		 845 aa  350  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  31.43 
 
 		 839 aa  335  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  31.62 
 
 		 833 aa  333  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.69 
 
 		 818 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  30.28 
 
 		 843 aa  331  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  28.89 
 
 		 838 aa  330  9e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  29.5 
 
 		 904 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.77 
 
 		 839 aa  328  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  30.35 
 
 		 843 aa  318  3e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  32.15 
 
 		 832 aa  312  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  31.57 
 
 		 875 aa  307  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  28.98 
 
 		 820 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.41 
 
 		 966 aa  299  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  31.07 
 
 		 738 aa  298  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  31.07 
 
 		 738 aa  297  7e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  29.2 
 
 		 850 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  31.37 
 
 		 897 aa  294  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  28.99 
 
 		 852 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.42 
 
 		 874 aa  283  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.28 
 
 		 886 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  29.1 
 
 		 805 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  29.13 
 
 		 902 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.06 
 
 		 881 aa  260  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  27.45 
 
 		 882 aa  258  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  27.86 
 
 		 882 aa  257  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  27.38 
 
 		 864 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  27.94 
 
 		 889 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  28.16 
 
 		 893 aa  247  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  28.05 
 
 		 816 aa  242  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  41.64 
 
 		 685 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  45.05 
 
 		 755 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  27.2 
 
 		 898 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  27.58 
 
 		 849 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.79 
 
 		 758 aa  228  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.79 
 
 		 749 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.68 
 
 		 497 aa  220  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  39.55 
 
 		 762 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.66 
 
 		 755 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  39.51 
 
 		 745 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  40.51 
 
 		 716 aa  206  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.66 
 
 		 780 aa  204  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  39.27 
 
 		 740 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  25.75 
 
 		 578 aa  202  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.07 
 
 		 737 aa  199  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.03 
 
 		 757 aa  197  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.23 
 
 		 750 aa  197  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.49 
 
 		 748 aa  197  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.99 
 
 		 751 aa  195  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.22 
 
 		 790 aa  195  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.98 
 
 		 734 aa  195  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.89 
 
 		 757 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.46 
 
 		 741 aa  192  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  39.72 
 
 		 800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  37.68 
 
 		 760 aa  191  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.61 
 
 		 750 aa  190  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  41.64 
 
 		 731 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  31.2 
 
 		 738 aa  190  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  40.3 
 
 		 814 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.17 
 
 		 711 aa  188  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  35.24 
 
 		 701 aa  188  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  37.63 
 
 		 747 aa  188  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  35.18 
 
 		 708 aa  187  6e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  28.96 
 
 		 895 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.84 
 
 		 933 aa  187  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.08 
 
 		 809 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.22 
 
 		 777 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  34.75 
 
 		 749 aa  184  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.09 
 
 		 758 aa  184  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  33.42 
 
 		 721 aa  184  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.76 
 
 		 724 aa  184  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  34.57 
 
 		 757 aa  183  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  34.17 
 
 		 714 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  39.84 
 
 		 793 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  39.84 
 
 		 793 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.38 
 
 		 813 aa  182  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  37.64 
 
 		 693 aa  182  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  38.69 
 
 		 927 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  39.93 
 
 		 748 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  41.41 
 
 		 691 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  34.16 
 
 		 721 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>