210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1156 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  70.88 
 
 		 576 aa  857    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  86.53 
 
 		 579 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1182    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  80.31 
 
 		 579 aa  966    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  71.23 
 
 		 576 aa  862    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  71.75 
 
 		 576 aa  862    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  70.36 
 
 		 585 aa  853    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  41.32 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  42.26 
 
 		 592 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  39.05 
 
 		 575 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  39.24 
 
 		 576 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  39.06 
 
 		 576 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  39.19 
 
 		 591 aa  365  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  30.36 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  30.72 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  31.15 
 
 		 508 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  29.64 
 
 		 547 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  30.8 
 
 		 547 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  28.6 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  29.72 
 
 		 547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  30.32 
 
 		 533 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  29.38 
 
 		 533 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  29.86 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  28.11 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  29.56 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  28.11 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  28.54 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  26.09 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  27.31 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  28.48 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  28.21 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  28.51 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  27.14 
 
 		 465 aa  151  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  25.88 
 
 		 464 aa  150  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  26.92 
 
 		 467 aa  150  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  28.04 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  28.13 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  28.06 
 
 		 468 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  27.68 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  28.24 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  27.54 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  25.44 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  27.68 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  27.1 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  27.58 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  26.86 
 
 		 468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  26.86 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  25.99 
 
 		 473 aa  137  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  25.85 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  25.39 
 
 		 463 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  25.16 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  27.81 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  25.21 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  25.21 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  23 
 
 		 438 aa  123  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  27.51 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  25.54 
 
 		 476 aa  120  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  27.75 
 
 		 473 aa  120  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.76 
 
 		 345 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  26.39 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  24.79 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  25.17 
 
 		 481 aa  104  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  32.54 
 
 		 237 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  32.66 
 
 		 280 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.26 
 
 		 457 aa  90.9  6e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  24.6 
 
 		 449 aa  87.4  7e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  24.44 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  23.24 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  28.57 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  25.93 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  27.84 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  25.93 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  42.86 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  35.96 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  32.17 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.14 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2003  peptidase, M20A family  28.81 
 
 		 480 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.69 
 
 		 442 aa  55.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0192  M20/M25/M40 family peptidase  28.81 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  36.79 
 
 		 394 aa  53.9  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.96 
 
 		 433 aa  53.9  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  27.89 
 
 		 459 aa  53.5  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  30.97 
 
 		 415 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  27.27 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  26.9 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.19 
 
 		 455 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40.68 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  28.93 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.25 
 
 		 405 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  30.82 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  28.71 
 
 		 416 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 		 404 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.9 
 
 		 409 aa  51.2  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  31.82 
 
 		 406 aa  50.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  25.95 
 
 		 443 aa  50.8  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  32.73 
 
 		 426 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  29.66 
 
 		 385 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  31.82 
 
 		 386 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>