More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0702 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  876    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0674  C-terminal processing peptidase  91.92 
 
 		 520 aa  807    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1430  carboxyl-terminal protease  48.89 
 
 		 504 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 436 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 433 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  33.44 
 
 		 440 aa  199  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  34.51 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  34.04 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  34.68 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  33.33 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  34.83 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  32.87 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  33.52 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  33.81 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  34.3 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  31.78 
 
 		 476 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  33.63 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  34.42 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  33.62 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  33.7 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35.01 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  34.12 
 
 		 438 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  32.51 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  33.33 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  31.52 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  34.32 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  33.82 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  32.09 
 
 		 401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  31.96 
 
 		 483 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  34.04 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  33.43 
 
 		 477 aa  183  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 		 444 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  31.14 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  33.84 
 
 		 444 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  34.15 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  32.49 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  34.05 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  32.49 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  32.84 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  34.04 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 		 422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  32.31 
 
 		 535 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  33.89 
 
 		 515 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  34.13 
 
 		 440 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  34.13 
 
 		 440 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  34.13 
 
 		 440 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.95 
 
 		 434 aa  179  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  33.74 
 
 		 451 aa  179  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  32.95 
 
 		 446 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  34.35 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 444 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  31.39 
 
 		 549 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  31.91 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 462 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  33.61 
 
 		 515 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  33.61 
 
 		 515 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  33.61 
 
 		 515 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  32.23 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  32.73 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  32.15 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  32.08 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  31.52 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  33.44 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  33.04 
 
 		 443 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  31.9 
 
 		 550 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  31.9 
 
 		 538 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  32.39 
 
 		 449 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  33.63 
 
 		 498 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  31.75 
 
 		 532 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  33.03 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  33.53 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  33.03 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  32.47 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  29.3 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  32.78 
 
 		 511 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  31.9 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  34.14 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  31.94 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>