161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2773 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  92.82 
 
 		 1267 aa  2331    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  70.18 
 
 		 1310 aa  1852    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1265 aa  2567    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  89.57 
 
 		 1268 aa  2262    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  92.9 
 
 		 1267 aa  2333    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  47.28 
 
 		 1335 aa  599  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1315 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  27.08 
 
 		 1301 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  27.51 
 
 		 1313 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  27.93 
 
 		 1314 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  27.51 
 
 		 1313 aa  406  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  27.93 
 
 		 1314 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  27.79 
 
 		 1315 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  27.84 
 
 		 1314 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1270 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1297 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1297 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1297 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  26.76 
 
 		 1288 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1297 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1297 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1297 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1297 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1313 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 		 831 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  30.42 
 
 		 831 aa  240  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  29.7 
 
 		 831 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  29.57 
 
 		 831 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  27.11 
 
 		 830 aa  225  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  30.09 
 
 		 830 aa  223  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  26.49 
 
 		 1230 aa  212  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  30.45 
 
 		 1199 aa  207  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1176 aa  196  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1204 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  30.81 
 
 		 1171 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1102 aa  186  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  26.04 
 
 		 1172 aa  185  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  29.47 
 
 		 1220 aa  181  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  28.93 
 
 		 1212 aa  180  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5271  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1156 aa  179  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1195 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3247  ImcF domain-containing protein  26.13 
 
 		 1114 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2911  ImcF domain-containing protein  25.82 
 
 		 1094 aa  173  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.951042  normal  0.253398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  29.34 
 
 		 1209 aa  172  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1192 aa  172  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3655  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1272 aa  172  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.851877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  32.15 
 
 		 1157 aa  171  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  31.46 
 
 		 1148 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0633  ImcF-like protein  25 
 
 		 1115 aa  167  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.201654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1179 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  28.71 
 
 		 1218 aa  167  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  30.55 
 
 		 1211 aa  164  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2989  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1140 aa  164  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000392845 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  29.83 
 
 		 1302 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2591  ImcF domain-containing protein  24.52 
 
 		 1140 aa  164  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  31.74 
 
 		 1179 aa  164  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2495  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1140 aa  164  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  29.92 
 
 		 1302 aa  163  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  29.67 
 
 		 1302 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1175 aa  162  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1205 aa  161  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  33.73 
 
 		 1176 aa  161  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1173 aa  161  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  28.23 
 
 		 1209 aa  161  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  28.23 
 
 		 1209 aa  161  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  28.03 
 
 		 1209 aa  160  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  25.08 
 
 		 1182 aa  160  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  28.62 
 
 		 1302 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 1209 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  28.23 
 
 		 1209 aa  160  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 1209 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 1209 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  28.23 
 
 		 1209 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  30.4 
 
 		 1302 aa  159  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1208 aa  159  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  32.75 
 
 		 1173 aa  159  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1798  ImcF domain-containing protein  24.39 
 
 		 1067 aa  159  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  27.82 
 
 		 1207 aa  158  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0795  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1140 aa  157  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  33.41 
 
 		 1289 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  33.41 
 
 		 1289 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1181 aa  155  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  33.41 
 
 		 1289 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  33.87 
 
 		 1289 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1175 aa  154  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  31.27 
 
 		 1164 aa  152  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  28.69 
 
 		 1275 aa  152  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1275 aa  152  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  33.44 
 
 		 1181 aa  152  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 1302 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  28.28 
 
 		 1150 aa  150  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1154 aa  149  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  28.32 
 
 		 1268 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  28.97 
 
 		 1329 aa  147  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  33.24 
 
 		 1152 aa  146  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  26.93 
 
 		 1187 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  29.82 
 
 		 1204 aa  140  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  29.03 
 
 		 1175 aa  140  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  24.2 
 
 		 1182 aa  140  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1168 aa  138  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>